《名侦探柯南》人鱼岛事件是241集。平次收到一封信，上面写着“会被人鱼杀死”的信，于是跟小五郎、柯南等一同来到了美国岛。他们去寻找送信人门协纱织，但她已经不知去向。正好岛上举行儒艮之祭，祭奠开始后，纱织的朋友寿美的尸体被发现，是在瀑布上吊身亡的。 寿美小姐死亡时间不到一个小时，只要跟着长筒靴的鞋印，就会找到凶手藏身的地方，但脚印却直接通向大海。平次和和叶找到了人鱼墓，却由于疏忽将两个人都处于了悬崖边缘的危险境地。另一方面，柯南让沉睡的小五郎说出了美国岛发生的杀人事件与人鱼传说的真相。
《名侦探柯南》的剧情内容高中生侦探工藤新一和青梅竹马的同学毛利兰一同去游乐园玩的时候，目击了黑衣男子的可疑交易现场。只顾偷看交易的工藤新一，却忽略了从背后接近的另一名同伙。他被那名男子灌下了毒药，当他醒来时，身体居然缩小了！如果让那些家伙知道工藤新一还活着的话，不仅性命难保，还会危及身边的人。在阿笠博士的建议下他决定隐瞒身份，在被小兰问及名字时，化名江户川柯南，为了搜集那些家伙的情报，寄住在父亲以侦探为业的小兰家中。谜团重重的黑衣组织……他所了解的，就只有他们是以酒的名称作为代号的。为了揭露那些家伙的真面目，小小侦探江户川柯南开始大显身手！